Тематический сетевой электронный научный журнал СКФНЦСВВ

Плодоводство
и виноградарство Юга России



Токмаков Сергей Вячеславович

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
лаборатория генетики и микробиологии
науч. сотрудник лаборатории

кандидат биологических наук

Статьи в журнале (всего: 25)


pdf
651 Кб
11 с.
Размножение и производство посадочного материала
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 634.232:58.085: 631.527
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-91-101
Ключевые слова: ЧЕРЕШНЯ, ЭМБРИОКУЛЬТУРА, IN VITRO, СОРТА, ГИБРИДЫ, СТРАТИФИКАЦИЯ

Реферат

Представлены результаты оценки влияния различных по продолжительности коротких сроков стратификации на получение здоровых микрорастений гибридов черешни из изолированных незрелых эмбрионов в культуре in vitro. Изучались три сорта черешни сверхраннего, раннего и среднего сроков созревания. Апробирована схема стерилизации незрелых костянок черешни с использованием дезинфицирующего средства в виде таблеток, содержащих натриевую соль дихлоризоциануровой кислоты. Применённый метод показал высокую эффективность, что проявлялось в низком проценте инфицированных пробирок. Было произведено 3 посева в различные сроки: сразу после съёма плодов, через 1 неделю, через 3 недели стратификации. Степень развития растений, введённых в культуру in vitro, определяли через 2, 3 и 5 недель. Оценку растений, имеющих корень и настоящие листья, проводили по 5-ти балльной шкале. На основании данных учёта степени развития растений, введённых в культуру in vitro, был построен график, показывающий, что наибольший процент нормально развивающихся эмбрионов сорта черешни Краснодарская ранняя наблюдался в группе, прошедшей стратификацию в течение трёх недель, по сравнению со стратифицированными одну неделю. В группе образцов сорта Краса Кубани наблюдается противоположная зависимость. Темпы и степень развития зародышей сорта Ярославна без стратификации находятся в среднем диапазоне между другими изучаемыми образцами с длительной и короткой стратификацией. Исходя из полученных данных, можно сделать вывод о превалировании сортовых особенностей образцов над длительностью стратификации в процессе увеличения выхода нормально развитых микрорастений, полученных из культуры эмбрионов черешни in vitro.

Ссылка на статью
Токмаков С. В., Супрун И. И., Степанов И. В., Лободина Е. В., Алехина Е. М. ВЛИЯНИЕ КОРОТКИХ ПЕРИОДОВ СТРАТИФИКАЦИИ НА РАЗВИТИЕ ИЗОЛИРОВАННЫХ НЕЗРЕЛЫХ ЭМБРИОНОВ ЧЕРЕШНИ В КУЛЬТУРЕ IN VITRO [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 91–101. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/10.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-91-101 (дата обращения: 24.04.2024).
pdf
567 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 634.8: 632.4: 575.174.015.3
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-41-50
Ключевые слова: ВИНОГРАД, МИЛДЬЮ, PLASMOPARA VITICOLA, ДНК-МАРКЕРЫ PLASMOPARA

Реферат

Оомицет Plasmopara viticola вызывает одно из наиболее вредоносных заболеваний винограда – милдью. В районах влажного климата Черноморского побережья Северного Кавказа патоген причиняет особый ущерб. В виде эпифитотии UDC Plasmopara viticola развивается 6-7 раз за 10 лет и может вызывать потери от 50 до 100 % урожая текущего года, несмотря на наличие большого числа фунгицидов, способных сдерживать вредоносность этого заболевания. Цель работы – апробация микросателлитных ДНК маркеров GOB, CES, ISA и BER для изучения разнообразия популяций P. viticola, паразитирующих на виноградниках Краснодарского края. Материалом для исследования служили виноградные листья различных сортов, поражённые милдью. Листья отобраны в мае-июле 2019 г. в различных точках Краснодарского края. ДНК P. viticola выделяли из поражённой ткани виноградных листьев набором «ЦитоСорб», разработанным компанией «Синтол» специально для диагностики фитопатогенов. Всего экстрагировано 8 образцов ДНК P. viticola. Исследование выполнено методом полимеразной цепной реакции с оптимизацией количества и длительности циклов, а также концентрации реагентов. Размер амплифицированных фрагментов локусов GOB, CES, ISA и BER оценивали с помощью автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 методом фрагментного анализа. Обработку данных осуществляли в программе Gene Mapper 4.1. Наибольший полиморфизм выявлен по маркеру GOB (15 типов аллелей в восьми исследуемых образцах). Маркеры GOB, CES, ISA и BER могут быть использованы для изучения популяций P. viticola, распространённых на виноградниках Краснодарского края.

Ссылка на статью
Макаркина М. В., Ильницкая Е. Т., Токмаков С. В., Лободина Е. В. АПРОБАЦИЯ ДНК-МАРКЕРОВ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ РАЗНООБРАЗИЯ ПАТОГЕНА PLASMOPARA VITICOLA [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 41–50. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/05.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-41-50 (дата обращения: 24.04.2024).
pdf
562 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 575.22
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-11-20
Ключевые слова: ПОДВОИ ЯБЛОНИ, ISSR, IRAP, ДНК-АНАЛИЗ, ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

Реферат

Богатство генетического инструментария даёт возможность осуществлять анализ филогении и генетического полиморфизма у исследуемых таксонов. К важным генетическим компонентам, встречающимся в большинстве геномов эукариот, можно отнести ретротранспозоны. Исходя из особенностей этих мобильных элементов генома исследование ретротранспозонов актуально для создания генетических маркеров. На данный момент распространение в генетических работах получили ДНК-маркеры, чей полиморфизм обусловлен ретротранспозонными вставками. Целью данной работы является поиск и обнаружение эффективных IRAP и ISSR маркеров для генотипирпования подвоев яблони. Исходя из качества полученного ДНК-фингерпринта, по каждому из задействованных в работе маркеров был осуществлен отбор наиболее информативных маркеров. Праймеры отобранных IRAP и ISSR маркеров будут использованы в дальнейшем для генотипирования подвоев. В результате выполненной работы на генотипах подвоев яблони из 5 IRAP маркеров 4 дали ДНК-фрагменты при постановке ПЦР. При этом 2 маркеров из общей выборки были определены как перспективные для дальнейшей работы. В группу перспективных маркеров вошли IRAP, обладающие наибольшим количеством амплифицированных фрагментов и легко интерпретируемым видом ДНК-фингерпринтов. К данной группе отнесены: Cass 1 и Сass 2. В случае апробации 8 ISSR для дальнейшей работы были отобраны 3 маркера. Дальнейшая работа будет направлена на проведение оценки генетического полиморфизма отобранных маркеров с последующим расширением объема анализируемой выборки образцов.

Ссылка на статью
Степанов И. В., Супрун И. И., Токмаков С. В., Лободина Е. В. ПОИСК ЭФФЕКТИВНЫХ IRAP И ISSR МАРКЕРОВ ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ПОДВОЕВ ЯБЛОНИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 11–20. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/02.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-11-20 (дата обращения: 24.04.2024).
pdf
143 Кб
8 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 19.01.2015
УДК: 575:577.2:576.3
Ключевые слова: ГЕНОТИПЫ VITIS VINIFERA, АБОРИГЕННЫЕ СОРТА ВИНОГРАДА, ПОЛИМОРФИЗМ SSR-ЛОКУСОВ.

Реферат

Изучение и сохранение генетического разнообразия представляет собой одну из наиболее важных научных проблем в генетике культурных растений. Аборигенные, стародавние сорта различных регионов возделывания винограда – ценная часть мирового генофонда этой культуры. При изучении генофонда винограда в настоящее время традиционные ампелографические описания дополняются молекулярно-генетическими данными. В наших исследованиях проведено генотипирование 14 автохтонных сортов винограда Дагестана: Асыл Кара, Баят капы, Гимра, Гуляби дагестанский, Джунга, Дубут, Мола гусейн цибил, Риш баба, Сарах, Тавлинский поздний, Хатал баар, Хоп халат, Хоца цибил, Шавраны. Получены ДНК-фигерпринты по микросателлитным локусам VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62 и VrZAG79. Указанные SSR-маркеры рекомендованы союзом генетиков винограда в качестве основных для генотипирования Vitis vinifera. Молекулярно-генетический анализ выполнен на автоматическом генетическом анализаторе, позволяющем получать данные, соответствующие современным мировым требованиям идентификации генотипов винограда. В работе было апробировано использование мультиплексной (полимеразной цепной реакции (ПЦР). Мультиплексные наборы позволяют оптимизировать время, затрачиваемое на ДНК-анализ и значительно снизить стоимость его проведения. Наибольший полиморфизм при изучении данной группы дагестанских сортов выявлен по локусу VVMD27: идентифицировано 9 аллелей на локус; наименьший полиморфизм отмечен по локусу VrZAG62: 5 аллелей/локус. Определены сорта винограда с редкими аллелями по изученным локусам в исследуемой выборке данной группы сортов. Показана информативность набора микросателлитных маркеров VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62 и VrZAG79 для фингерпринтинга проанализированной выборки сортов винограда.

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Токмаков С. В., Супрун И. И., Макаркина М. В. ФИНГЕРПРИНТИНГ АБОРИГЕННЫХ ДАГЕСТАНСКИХ СОРТОВ ВИНОГРАДА ПО ДАННЫМ МИКРОСАТЕЛЛИТНОГО АНАЛИЗА [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2015. № 31(1). С. 22–29. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/15/01/02.pdf. (дата обращения: 24.04.2024).
pdf
613 Кб
11 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 20.01.2021
УДК: 575.11: 634.84
DOI: 10.30679/2219-5335-2021-1-67-91-101
Ключевые слова: ВИНОГРАД, ГЕНОТИП, СОРТА-СИНОНИМЫ, АБОРИГЕННЫЕ СОРТА, ДНК-ПАСПОРТИЗАЦИЯ

Реферат

Центральная часть Абхазии признана одним из регионов возникновения культурной виноградной лозы. Здесь произрастают как известные сорта, которые создали славу местных вин, так и малоизученные генотипы и дикорастущие формы. Изучение местного генофонда винограда на молекулярно-генетическом уровне даёт возможность более полно оценить генетическое разнообразие сортов и форм, выявить более близкие и отдалённые генотипы. В рамках изучения винограда Абхазии нами проводится ДНК-профилирование аборигенных сортов. Цель данной работы – изучение генотипа сорта Ажьшкуакуа (Ажижкваква). В работе использовали виноградные растения сорта Ажьшкуакуа, произрастающие в коллекции агрофирмы «Вина и воды Абхазии», соответствующие сортовому описанию. Экстракцию ДНК проводили из апикальной части молодых побегов растений методом на основе использования ЦTAБ. Генотипирование проведено с помощью SSR-маркеров, рекомендованных для идентификации сортов винограда: VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD25, VVMD27, VVMD28, VVMD32, VrZAG62, VrZAG79. Амплифицированные продукты ПЦР-реакции оценивали методом капиллярного электрофореза с использованием автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 с последующим определением размеров с помощью программ GeneMapper и PeakScanner, корректируя значения с учётом данных контрольного (референсного) генотипа с известным аллельным составом (Пино нуар). Анализ полученного ДНК-профиля Ажижкваква в международной базе ДНК-паспортов сортов винограда выявил соответствие его профилю сорта Цицка, который считается аборигенным сортом Грузии. Генотипы указанных сортов можно считать синонимами, так как они имеют практически идентичные морфологические признаки. Согласно проанализированным нами литературным и молекулярно-генетическим данным, подтверждающим высокую степень генетического сходства сортов, можно предположить, что эти сорта – клоновые вариации одного генотипа.

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Токмаков С. В., Айба В. Ш. ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОТИПА АБОРИГЕННОГО АБХАЗСКОГО СОРТА ВИНОГРАДА АЖЬШКУАКУА (АЖИЖКВАКВА) [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2021. № 67(1). С. 91–101. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/21/01/07.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2021-1-67-91-101 (дата обращения: 24.04.2024).