Тематический сетевой электронный научный журнал СКФНЦСВВ

Плодоводство
и виноградарство Юга России



Лободина Елена Вадимовна

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
лаборатория генетики и микробиологии СКЗНИИСиВ
мл. научный сотрудник

-

Статьи в журнале (всего: 16)


pdf
567 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 634.8: 632.4: 575.174.015.3
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-41-50
Ключевые слова: ВИНОГРАД, МИЛДЬЮ, PLASMOPARA VITICOLA, ДНК-МАРКЕРЫ PLASMOPARA

Реферат

Оомицет Plasmopara viticola вызывает одно из наиболее вредоносных заболеваний винограда – милдью. В районах влажного климата Черноморского побережья Северного Кавказа патоген причиняет особый ущерб. В виде эпифитотии UDC Plasmopara viticola развивается 6-7 раз за 10 лет и может вызывать потери от 50 до 100 % урожая текущего года, несмотря на наличие большого числа фунгицидов, способных сдерживать вредоносность этого заболевания. Цель работы – апробация микросателлитных ДНК маркеров GOB, CES, ISA и BER для изучения разнообразия популяций P. viticola, паразитирующих на виноградниках Краснодарского края. Материалом для исследования служили виноградные листья различных сортов, поражённые милдью. Листья отобраны в мае-июле 2019 г. в различных точках Краснодарского края. ДНК P. viticola выделяли из поражённой ткани виноградных листьев набором «ЦитоСорб», разработанным компанией «Синтол» специально для диагностики фитопатогенов. Всего экстрагировано 8 образцов ДНК P. viticola. Исследование выполнено методом полимеразной цепной реакции с оптимизацией количества и длительности циклов, а также концентрации реагентов. Размер амплифицированных фрагментов локусов GOB, CES, ISA и BER оценивали с помощью автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 методом фрагментного анализа. Обработку данных осуществляли в программе Gene Mapper 4.1. Наибольший полиморфизм выявлен по маркеру GOB (15 типов аллелей в восьми исследуемых образцах). Маркеры GOB, CES, ISA и BER могут быть использованы для изучения популяций P. viticola, распространённых на виноградниках Краснодарского края.

Ссылка на статью
Макаркина М. В., Ильницкая Е. Т., Токмаков С. В., Лободина Е. В. АПРОБАЦИЯ ДНК-МАРКЕРОВ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ РАЗНООБРАЗИЯ ПАТОГЕНА PLASMOPARA VITICOLA [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 41–50. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/05.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-41-50 (дата обращения: 21.04.2024).
pdf
562 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 575.22
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-11-20
Ключевые слова: ПОДВОИ ЯБЛОНИ, ISSR, IRAP, ДНК-АНАЛИЗ, ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

Реферат

Богатство генетического инструментария даёт возможность осуществлять анализ филогении и генетического полиморфизма у исследуемых таксонов. К важным генетическим компонентам, встречающимся в большинстве геномов эукариот, можно отнести ретротранспозоны. Исходя из особенностей этих мобильных элементов генома исследование ретротранспозонов актуально для создания генетических маркеров. На данный момент распространение в генетических работах получили ДНК-маркеры, чей полиморфизм обусловлен ретротранспозонными вставками. Целью данной работы является поиск и обнаружение эффективных IRAP и ISSR маркеров для генотипирпования подвоев яблони. Исходя из качества полученного ДНК-фингерпринта, по каждому из задействованных в работе маркеров был осуществлен отбор наиболее информативных маркеров. Праймеры отобранных IRAP и ISSR маркеров будут использованы в дальнейшем для генотипирования подвоев. В результате выполненной работы на генотипах подвоев яблони из 5 IRAP маркеров 4 дали ДНК-фрагменты при постановке ПЦР. При этом 2 маркеров из общей выборки были определены как перспективные для дальнейшей работы. В группу перспективных маркеров вошли IRAP, обладающие наибольшим количеством амплифицированных фрагментов и легко интерпретируемым видом ДНК-фингерпринтов. К данной группе отнесены: Cass 1 и Сass 2. В случае апробации 8 ISSR для дальнейшей работы были отобраны 3 маркера. Дальнейшая работа будет направлена на проведение оценки генетического полиморфизма отобранных маркеров с последующим расширением объема анализируемой выборки образцов.

Ссылка на статью
Степанов И. В., Супрун И. И., Токмаков С. В., Лободина Е. В. ПОИСК ЭФФЕКТИВНЫХ IRAP И ISSR МАРКЕРОВ ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ПОДВОЕВ ЯБЛОНИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 11–20. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/02.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-11-20 (дата обращения: 21.04.2024).
pdf
499 Кб
11 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 20.11.2022
УДК: 575.22
DOI: 10.30679/2219-5335-2022-6-78-162-172
Ключевые слова: SCOT-МАРКЕРЫ, ИДЕНТИФИКАЦИЯ, ЯБЛОНЯ, КОНТРОЛЬ СОРТОВОЙ ЧИСТОТЫ

Реферат

Контроль сортовой чистоты посадочного материала является существенным фактором, влияющим на производительность садоводческих хозяйств. К современным методам контроля сортовой чистоты саженцев плодовых культур, обладающим перспективой внедрения в широкую практику, можно отнести SCoT-маркеры (Start Codon Targeted). В связи с чем, исходя из перспективности использования SCoT-маркеров в работах по идентификации растительного материала, была проведена работа по отбору эффективных комбинаций SCoT-маркеров. Для повышения числа возможных вариантов маркирования был использован подход, основанный на создании маркеров из двух SCoT-праймеров. Целью данной работы был отбор комбинаций SCoT-маркеров, перспективных для ДНК-фингерпринтинга яблони, что в дальнейшем позволит использовать лучшие комбинации в идентификации посадочного материала. В работе представле-ны результаты оценки сочетаний SCoT-маркеров, для идентификации представителей рода Malus. 18 SCoT-маркеров на основе предварительной оценки были сгруппированы в 68 комбина-ций. Отбор эффективных комбинаций марке-ров осуществлялся по ряду необходимых критериев, таких как высокое качество ДНК-фингерпринтов и значительное количество полиморфных амплифицирован-ных ДНК-фрагментов. Особенно значимы данные характеристики при генетической оценке близкородственных генотипов. Требования к качеству ДНК-фингерпринтов значительно повышаются, что обусловлено большим количеством идентичных ДНК-фрагментов. Около 45 % комбинаций были удачными и отобраны для дальнейших работ как перспективные. Апробация, проведённая в работе, дала возможность определить перспективные маркеры среди 68 задействованных в исследовании. Комбинации SCoT-праймеров, отобранных в данной работе, могут быть использованы в различных направлениях, включая генетическую идентификацию образцов, анализ генетической однородности растений, получаемых в процессе микроклонального размножения, а также для выполнения исследования по изучению генетических взаимосвязей образцов.

Ссылка на статью
Степанов И. В., Балапанов И. М., Лободина Е. В., Супрун И. И. ПРИМЕНЕНИЕ КОМБИНАЦИЙ SCOT-МАРКЕРОВ ДЛЯ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ СОРТОВ ЯБЛОНИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2022. № 78(6). С. 162–172. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/22/06/09.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2022-6-78-162-172 (дата обращения: 21.04.2024).
pdf
537 Кб
15 с.
Переработка продукции растениеводства
Дата публикации: 23.09.2019
УДК: 663.252.41: 575.22
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-5-59-118-132
Ключевые слова: ВИННЫЕ ДРОЖЖИ, ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ, АВТОХТОННЫЕ ПОПУЛЯЦИИ, МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЙ АНАЛИЗ, ШТАММ, ФИЗИОЛОГОБИОХИМИЧЕСКИИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ

Реферат

Производство российского вина основано на использовании активных сухих дрожжей, ввозимых в РФ из стран Европы – Франции, Германии, Италии. Между тем, известно, что высококачественные вина географического наименования необходимо производить с применением местных рас дрожжей. Поиск таких рас (штаммов) является актуальной задачей. Анализ генетического разнообразия популяций дикорастущих дрожжей и создание их коллекций является необходимым начальным этапом в создании новых перспективных штаммов для промышленного виноделия. Такие исследования постоянно проводятся в Европе для создания терруарспецефических штаммов дрожжей. Отбор проб винограда для выделения и изучения новых местных штаммов винных дрожжей проводили в виноградарских хозяйствах Темрюкского и Анапского районов Краснодарского края. Выделение ДНК, условия проведения ЦР и фрагментного анализа выполняли согласно действующим методикам. Для анализа полиморфизма длин амплифицируемых фрагментов при SSR-генотипировании использовали фрагментный анализ на автоматическом генетическом анализаторе ABIprism 3130. Полученные данные визуализировали в программе Gene Mapper v 4.1. Установлено разнообразие видов и родов дрожжей на поверхности ягод винограда. При этом «выход» сахаромицетов составил порядка 30 % от общего количества полученных моноспоровых культур для каждой из точек отбора. Приведены результаты анализа генетических взаимосвязей и ряда технологических характеристик штаммов Saccharomyces sp., выделенных из естественных популяций в ампелоценозах. Выявлено, что географический фактор влиял на возникновение генетической изоляции. Показано, что генетически удалённые штаммы проявляют значительные различия по ряду физиолого-биохимических характеристик.

Ссылка на статью
Супрун И. И., Агеева Н. М., Лободина Е. В., Насонов А. И., Токмаков С. В., Прах А. В. АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ЕСТЕСТВЕННЫХ ПОПУЛЯЦИЙ РОДА SACCHAROMYCES КАК ОСНОВА ПОИСКА ШТАММОВ, ПЕРСПЕКТИВНЫХ ДЛЯ ВИНОДЕЛИЯ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 59(5). С. 118–132. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/05/11.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-5-59-118-132 (дата обращения: 21.04.2024).
pdf
575 Кб
12 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 25.01.2024
УДК: 635:631.532:58.084.1
DOI: 10.30679/2219-5335-2024-1-85-174-185
Ключевые слова: ОРЕХ ГРЕЦКИЙ, СЕЛЕКЦИЯ ОРЕХА ГРЕЦКОГО, ПЛОДЫ, ВЫХОД ЯДРА, ХОЗЯЙСТВЕННО ЦЕННЫЕ ПРИЗНАКИ

Реферат

В последнее время решается задача по обновлению сортимента ореха грецкого новыми адаптивными и высококачественными сортами отечественной селекции, так как зарубежные сорта не в полной мере могут реализовать свой биологический потенциал в условиях Северного Кавказа. Для того чтобы решить вопрос импортозамещения, необходимо создавать конкурентоспособные, высокопродуктивные сорта с латеральным плодоношением, адаптивные к неблагоприятным факторам. При этом чрезвычайно важной характеристикой сорта является качество плодов. В статье представлены результаты исследований по поиску перспективных форм грецкого ореха. В ходе маршрутных выездов была проведена предварительная оценка исследуемых образцов на наличие латерального плодоношения и нагрузки плодами, в результате которой выделено 11 перспективных форм для оценки морфометрических характеристик и качества плодов. Все 11 отобранных форм ореха грецкого представляют ценность для селекции и могут служить источниками хозяйственно полезных признаков (латеральное плодоношение, крупноплодность, высокий процент выхода ядра, светлое, хорошо выполненное ядро, тонкая скорлупа). Формы № 1, № 3, № 4, № 5, № 6, № 7, № 8, № 10 по комплексу фенотипических характеристик плодов можно считать наиболее перспективными. Данные образцы имеют средний (№ 1, № 5, № 7, № 8) и высокий (№ 3, № 4, № 6, № 11) процент выхода ядра, хорошую извлекаемость ядра, выполненность ядра и могут быть использованы в селекционных работах, как источники хозяйственно ценных признаков.

Ссылка на статью
Аль-Накиб Е. А., Супрун И. И., Лободина Е. В., Авакимян А. О. ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ПЛОДОВ ПЕРСПЕКТИВНЫХ ФОРМ ОРЕХА ГРЕЦКОГО ИЗ МЕСТНЫХ СЕМЕННЫХ ПОПУЛЯЦИЙ КРАСНОДАРСКОГО КРАЯ И БЕЛГОРОДСКОЙ ОБЛАСТИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2024. № 85(1). С. 174–185. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/24/01/09.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2024-1-85-174-185 (дата обращения: 21.04.2024).