Тематический сетевой электронный научный журнал СКФНЦСВВ

Плодоводство
и виноградарство Юга России



Котляр Виктория Константиновна

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
лаборатория сортоизучения и селекции винограда
младший научный сотрудник

-

Статьи в журнале (всего: 6)


pdf
485 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 15.01.2020
УДК: 634.84.09: 575.222.72: 575.113
DOI: 10.30679/2219-5335-2020-1-61-44-53
Ключевые слова: ВИНОГРАД, УСТОЙЧИВОСТЬ К МИЛДЬЮ, VITIS AMURENSIS, ДНК-МАРКЕРЫ, RPV10, RPV12

Реферат

Основные сорта винограда, используемые как столовые сорта и для виноделия, принадлежат к виду Vitis vinifera L., который имеет высокое качество ягод, но довольно низкую устойчивость к болезням и морозу. Одним из доноров ценных признаков для селекции сортов винограда является вид Vitis amurensis Rupr. Например, некоторые генотипы V.amurensis несут гены устойчивости к милдью Rpv10 и Rpv12. Цель работы – изучить генетический потенциал устойчивости к милдью методом ДНК-маркерного анализа некоторых гибридных форм, полученных с использованием амурского винограда. Исследовались ДНК двадцати одного генотипа винограда, созданных Ф.И. Шатиловым с использованием V. аmurensis, и сохраняемых в коллекции А.Ю. Немытова (Оренбургская область). Экстракцию ДНК осуществляли методом ЦТАБ из гербаризированных молодых побегов растений винограда. В работе по идентификации гена Rpv10 использовали тесно сцепленный ДНК-маркер GF09-46, для выявления гена Rpv12 – маркеры UDV360, UDV343, фланкирующие локус устойчивости. Разделение продуктов реакции и анализ размера ПЦР-фрагментов проводили с использованием автоматического генетического анализатора. В качестве контрольных генотипов в исследования были включены сорта винограда, которые являются носителями генов: Кунлеань (Rpv12) и Саперави северный (Rpv10). В двух формах под условными названиями «Мускат сверхранний № 1» и «Гибридная форма № 3» выявлено наличие генов Rpv12 и Rpv10, соответственно. Данные генотипы обладают рядом положительных характеристик, перспективных в селекции столовых сортов винограда, и могут быть рассмотрены в качестве источников ценных признаков.

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Токмаков С. В., Котляр В. К., Немытов А. Ю. ДНК-МАРКЕРНОЕ ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОТЕНЦИАЛА УСТОЙЧИВОСТИ К МИЛДЬЮ В ГИБРИДНЫХ ФОРМАХ ОТ VITIS AMURENSIS [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2020. № 61(1). С. 44–53. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/20/01/04.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2020-1-61-44-53 (дата обращения: 18.10.2021).
pdf
480 Кб
13 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 15.05.2020
УДК: 634.84.09: 575.222.72: 575.113
DOI: 10.30679/2219-5335-2020-3-63-1-13
Ключевые слова: ВИНОГРАД, ДНК-ПАСПОРТИЗАЦИЯ, ПАТОГЕНЫ, ИДЕНТИФИКАЦИЯ, ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ, ГЛУБОКОЕ СЕКВИНИРОВАНИЕ

Реферат

Виноград является ценным культурным растением для человека. Его используют в свежем виде, в качестве сырья для соковой, винодельческой и консервной промышленности, перерабатывают на различные виды сушёных изделий. Из общего количества производимого в мире винограда 80-90 % используется для переработки на вина, соки и другие продукты, до 10 % винограда потребляется в свежем виде и 5-6% идет на сушку. Промышленное ведение высококачественных виноградных насаждений и питомников невозможно без применения научных знаний, которые позволяют выявить наиболее продуктивные сорта винограда для конкретных агроклиматических зон, определить чистосортность растений, диагностировать фитопатогены в посадочном материале и существующих насаждениях. Одними из самых эффективных методов для решения задач питомниководства являются молекулярно-генетические, которые широко применяются для ДНК-паспортизации, определения происхождения винограда и идентификации патогенов в посадочном материале. ДНК-профилирование позволяет отсеивать мутантные формы на раннем этапе или отбирать их для проведения дальнейших исследований. Диагностика патогенов в маточных насаждениях и посадочном материале включает в себя идентификацию болезнетворных организмов и раннее выявление бессимптомно протекающих заболеваний (вирусов, фитоплазменных инфекций, трахеомикозов, бактериального рака). К методам контроля посадочного материала, которые повсеместно применяются в питомниководстве, можно отнести: иммуноферментный анализ, помещение в маточные насаждения индикаторных растений, метод ПЦР и «глубокое секвенирование». Использование этих методов в питомниководстве позволяет верно идентифицировать сортовую принадлежность материала на ранних этапах, вовремя выявить наличие патогенов и совершить своевременный комплекс защитных мероприятий, что в последующем обеспечит эффективное развитие и высокое качество маточных насаждений.

Ссылка на статью
Котляр В. К., Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Лободина Е. В. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ДЛЯ СОРТОВОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ И УСКОРЕННОЙ ДИАГНОСТИКИ ЛАТЕНТНЫХ ФОРМ ФИТОПАТОГЕНОВ В РЕШЕНИИ ЗАДАЧ ПИТОМНИКОВОДСТВА ВИНОГРАДА [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2020. № 63(3). С. 1–13. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/20/03/01.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2020-3-63-1-13 (дата обращения: 18.10.2021).
pdf
786 Кб
15 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 16.03.2021
УДК: 634.8: 575.162: 632.9
DOI: 10.30679/2219-5335-2021-2-68-79-93
Ключевые слова: DAKTULOSPHAIRA VITIFOLIAE, ВИНОГРАД, ДНК-МАРКЕРЫ, ГЕНЫ УСТОЙЧИВОСТИ

Реферат

Виноградная филлоксера Daktulosphaira vitifoliae представляет собой небольшое инвазивное сосущее насекомое, которое оказывает существенное физическое и экономическое влияние на возделывание винограда. Вредоносность корневой формы филлоксеры различна для европейских и американских сортов. Европейским сортам она причиняет значительно больший ущерб. Данный патоген был завезён в Европу на американских подвоях, изначально импортированных на континент как устойчивый материал для борьбы с оидиумом и милдью. Во Франции в 1868 году вредитель опустошил французскую винодельческую промышленность, уничтожив более 1 миллиона га непривитых виноградников. Вредный организм эволюционировал совместно с североамериканскими сортами Vitis spp., и генетическая устойчивость к этому патогену существует у нескольких видов винограда из этой группы. Молекулярно-генетические маркеры приносят много новых методик и вносят большой вклад в биологические науки и сельское хозяйство. Метод маркер опосредованного отбора особенно перспективен для селекции многолетних культур. В настоящее время идентифицирован ряд генов, отвечающих за устойчивость к филлоксере, обозначенных как Rdv1-8. Так, гены Rdv1-3 были идентифицированы в генплазме V. cinerea, а гены Rdv6-8 – в генплазме M. rotundifolia. Гены Rdv3 и Rdv4 влияют на устойчивость к поражению листовой формой филлоксеры. Использование существующих методов и последних достижений в области молекулярных и геномных методов могло бы привести к созданию сортов, не восприимчивых к корневой форме филлоксеры. Селекция винограда с использованием сложных межвидовых скрещиваний дает возможность сочетания устойчивости к болезням и вредителям, качества урожая и устойчивости к абиотическим стрессам.

Ссылка на статью
Котляр В. К., Ильницкая Е. Т. К ВОПРОСУ О ГЕНЕТИКЕ УСТОЙЧИВОСТИ ВИНОГРАДА К ФИЛЛОКСЕРЕ (DAKTULOSPHAIRA VITIFOLIAE) [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2021. № 68(2). С. 79–93. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/21/02/07.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2021-2-68-79-93 (дата обращения: 18.10.2021).
pdf
1418 Кб
13 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 16.03.2021
УДК: 575.11: 634.84
DOI: 10.30679/2219-5335-2021-2-68-66-78
Ключевые слова: СОРТА ВИНОГРАДА, ПОЛИМОРФИЗМ SSR-ЛОКУСОВ, ДИКОРАСТУЩИЕ ФОРМЫ

Реферат

Территория Республики Абхазия признана одним из регионов возникновения культурной виноградной лозы. Здесь есть множество аборигенных сортов и дикорастущих форм винограда. Изучение генофонда винограда на молекулярно-генетическом уровне даёт возможность более полно оценить генетическое разнообразие сортов и форм, выявить близкие и отдалённые генотипы. Цель данной работы – изучение дикорастущих форм винограда Абхазии. Поиск дикорастущих форм был проведён в Гудаутском, Гагрском и Сухумском районах Республики Абхазии, в местностях отдалённых и достаточно изолированных от возделываемых виноградников. Для исследования было отобрано 7 образцов. Выполнено описание найденных форм винограда по морфологическим признакам. ДНК выделяли методом ЦТАБ из апикальных частей побегов виноградных растений. Генотипирование проведено с помощью 11 SSR-маркеров: VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD25, VVMD27, VVMD28, VVMD32, VrZAG62, VrZAG79, UDV737 и GF09-46. Амплифицированные продукты ПЦР-реакции оценивали методом капиллярного электрофореза с использованием автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 с последующим определением размеров с помощью программ GeneMapper и PeakScanner, корректируя значения с учётом данных референсных генотипов с известным аллельным составом. Статистическая обработка данных полиморфизма микросателлитных локусов проведена в программе GenAlEx 6.5. Анализ полученных ДНК-профилей в международной базе данных ДНК-паспортов сортов винограда совпадений не обнаружил. Выявлено, что три анализируемых образца, собранных

Ссылка на статью
Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Красильников А. А., Котляр В. К., Айба В. Ш. ИССЛЕДОВАНИЕ ДИКОРАСТУЩИХ ФОРМ ВИНОГРАДА ИЗ ТРЕХ ГЕОГРАФИЧЕСКИХ ТОЧЕК АБХАЗИИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2021. № 68(2). С. 66–78. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/21/02/06.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2021-2-68-66-78 (дата обращения: 18.10.2021).
pdf
633 Кб
11 с.
Фитосанитарное состояние растений
Дата публикации: 20.01.2021
УДК: 63: 632.3.01/.08
DOI: 10.30679/2219-5335-2021-1-67-283-293
Ключевые слова: ВИНОГРАД, ФИТОПЛАЗМА, ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ, ДИАГНОСТИКА, ЦТАБ

Реферат

Одним из лимитирующих факторов стабильно высоких урожаев с хорошим качеством являются различные болезни культуры. Например, заболевания, вызванные фитоплазмами, могут оказывать серьезное негативное влияние на количество получаемого урожая и его качество, что в дальнейшем может сказаться на качестве винной продукции и получаемой прибыли. Фитоплазмы являются одними из наиболее опасных фитопатогенов. На винограде они представлены двумя видами – Candidatus Phytoplasma vitis Flavescence dorée (вызывает золотистое пожелтение винограда) и Candidatus Phytoplasma solani Bois noir (почернение коры). Многие болезни растений, которые, как считается, вызываются фитоплазмами, были описаны до того, как с помощью молекулярногенетических исследований были определены различные группы фитоплазм, вызывающие эти болезни. Теперь можно оценить взаимосвязь между классификацией фитоплазм и конкретными болезнями растений. Золотистое пожелтение листьев является карантинным для РФ и Евросоюза заболеванием и наносит большой урон виноградникам, поэтому быстрая и точная идентификация этого заболевания очень важна. Основным методом идентификации фитоплазм является ПЦР в реальном времени (RT-PCR) со специфическими праймерными системами. Целью нашего исследования было сравнить методы выделения ДНК из растительной ткани, пораженной фитоплазмой, для дальнейшей постановки ПЦР в реальном времени. Данное исследование показало, что образцы, выделенные с помощью коммерческих наборов «АгроДиагностика» и «ЦитоСорб», показывают схожие результаты, в то время как образец, выделенный лабораторным методом на основе использования ЦТАБбуфера, показал более высокие и ранние пики на графике, что имеет значение при детекции малого количества патогена в исследуемом материале и доказывает большую эффективность данного способа выделения.

Ссылка на статью
Котляр В. К., Макаркина М. В., Степанов И. В., Ильницкая Е. Т. ПОДБОР ОПТИМАЛЬНОЙ МЕТОДИКИ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК ВОЗБУДИТЕЛЯ ЗОЛОТИСТОГО ПОЖЕЛТЕНИЯ ВИНОГРАДА И ПОЧЕРНЕНИЯ КОРЫ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПАТОГЕНА МЕТОДОМ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2021. № 67(1). С. 283–293. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/21/01/19.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2021-1-67-283-293 (дата обращения: 18.10.2021).