Тематический сетевой электронный научный журнал СКФНЦСВВ

Плодоводство
и виноградарство Юга России



Степанов Илья Владимирович

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
лаборатории генетики и микробиологии
мл. научный сотрудник

-

Статьи в журнале (всего: 11)


pdf
525 Кб
11 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 01.08.2023
УДК: 634.1:631.52
DOI: 10.30679/2219-5335-2023-4-82-1-11
Ключевые слова: ЯБЛОНЯ, СОРТ, ГЕНОТИП, ГЕН, ДНК-МАРКИРОВАНИЕ, УСТОЙЧИВОСТЬ, ПАРША

Реферат

Для решения современных задач селекции яблони приоритетны исследования, направленные на мобилизацию биоресурсов рода Malus Mill., в том числе с использованием комплекса методов фенотипической оценки и ДНК-анализа для выявления новых высокоценных доноров значимых признаков для оптимизации ряда важнейших этапов селекционного процесса. Объекты исследования – 22 гибридные формы яблони (Malus × domestica Borkh.) различного генетического происхождения. Гибридные насаждения яблони корнесобственные 2017 года посадки, расположены в АО ОПХ «Центральное» (Краснодар). В качестве контроля наличия гена Rvi6 использован стандартный дифференциатор – Priscilla, а также сорта яблони коллекции СКФНЦСВВ: Союз, Орфей, Florina. НИР проводили в СКФНЦСВВ, использованы Центр коллективного пользования высокотехнологичным оборудованием и Центр коллективного пользования биорастительными ресурсами. Цель исследования – выделение гомозиготных форм по гену Rvi6 устойчивости к Venturia inaequalis (Cooke) Wint. среди гибридного материала яблони для дальнейшего селекционного использования. Использованы программы и методики селекции и сортоизучения. Применен метод ПЦР-анализа для идентификации наличия гомозиготности по доминантному аллелю гена Rvi6 с использованием кодоминантного маркера AL07 у 22 новых гибридов, полученных от родительских форм, несущих ген Rvi6 в гетерозиготе: Кармен, Liberty, Gemeni, Renuartsiv, Modi, Fujion, 12/1-21-63, 2034. По результатам ДНК-анализа установлено, что 4 из 22 изученных образцов гомозиготны по доминантному аллелю гена Rvi6; 10 – гетерозиготны. Выявлены ценные для селекции гомозиготы по гену устойчивости к парше Rvi6: 17/1-6-66, 17/2-6-4 (из семьи 12/1-21-63 × Modi); 17/2-5-19, 17/2-5-20 (Кармен × Modi). Результаты исследования могут быть использованы для планирования схем опыления при гибридизации, пополнения идентифицированных коллекций новыми донорами, структурирования генофонда, дополнения и развития информационных баз данных для использования в селекционной работе и в производстве.

Ссылка на статью
Ульяновская Е. В., Чернуцкая Е. А., Балапанов И. М., Степанов И. В. МАРКЕРНЫЙ ОТБОР ГОМОЗИГОТНЫХ ПО ГЕНУ RVI6 УСТОЙЧИВОСТИ К VENTURIA INAEQUALIS (COOKE) WINT. ГИБРИДНЫХ ФОРМ ЯБЛОНИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2023. № 82(4). С. 1–11. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/23/04/01.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2023-4-82-1-11 (дата обращения: 02.10.2023).
pdf
517 Кб
12 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 02.06.2023
УДК: 634.1:631.52
DOI: 10.30679/2219-5335-2023-3-81-157-168
Ключевые слова: ЯБЛОНЯ, СОРТ, ГЕНОТИП, ГЕН, ДНК-МАРКИРОВАНИЕ, САМОНЕСОВМЕСТИМОСТЬ

Реферат

Исследования проводили согласно общепринятым и разработанным в ФГБНУ СКФНЦСВВ программам и методикам сортоизучения и селекции в центре коллективного пользования «Исследовательско-селекционная коллекция генетических ресурсов садовых культур». Объекты исследований – 57 сортов и форм яблони (Malus × domestica Borkh.) разной плоидности, эколого-географического и генетического происхождения. Цель исследования – изучение аллельного полиморфизма по гену самонесовместимости при опылении у представителей рода Malus Mill. для использования в процессе селекции яблони. Для приготовления препарата ДНК использован CTAB-метод. Для идентификации аллелей S2, S3, S5, S7 и S10 искомого гена использован метод ПЦР-анализа. Выявлено, что данные аллели гена S имеют значительную разницу в частоте встречаемости в изученной выборке. Наиболее распространен аллель S2, частота встречаемости которого в выборке максимальна – 40,35 %; частота встречаемости аллелей S3, S5, S7 и S10 существенно ниже (в 1,9-4,6 раз) и составляет 21,05 %; 8,77 %; 17,54 % и 21,05 %, соответственно. Среди иммунных к парше сортов яблони наиболее распространены аллели S2 и S10 (частота распространения 54,17 % и 33,33 %, соответственно). По результатам ДНК-анализа среди 57 образцов выборки у 10 сортов: Виктория, Вирджиния, Гертруда, Джон Дауни, Желтозеленое, Империал Павла, Кетни, Никита, Рислинг красный, Флоркинг не выявлено наличие аллелей S2, S3, S5, S7 и S10. За исключением сортов Виктория и Вирджиния с низкой жизнеспособностью пыльцы, остальные сорта выделены как перспективные опылители (с учетом сроков и длительности периода цветения, степени жизнеспособности пыльцы) для использования в селекции и производстве. Полученные результаты анализа данной выборки сортов яблони важны для решения задач структурирования коллекционного фонда, пополнения информационных баз данных, выявления лучших опылителей для селекционных исследований и использования в производстве.

Ссылка на статью
Ульяновская Е. В., Чернуцкая Е. А., Балапанов И. М., Степанов И. В. АЛЛЕЛЬНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ КОЛЛЕКЦИОННЫХ ОБРАЗЦОВ MALUS MILL. ПО ГЕНУ S САМОНЕСОВМЕСТИМОСТИ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2023. № 81(3). С. 157–168. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/23/03/09.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2023-3-81-157-168 (дата обращения: 02.10.2023).
pdf
732 Кб
12 с.
Фитосанитарное состояние растений
Дата публикации: 15.11.2017
УДК: 634.2:631.52:632.4
Ключевые слова: УСТОЙЧИВОСТЬ К КОККОМИКОЗУ, ЭКСПРЕСС-МЕТОДЫ ОЦЕНКИ УСТОЙЧИВОСТИ, БИОХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ОЦЕНКИ, СТАТИСТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ, КАЧЕСТВЕННЫЙ МАТЕРИАЛ

Реферат

Главная цель работы – разработка методологического подхода к оценке степени устойчивости генотипов косточковых культур к фитопатогенам для выявления форм с долговременной устойчивостью, возделывание которых позволит снизить пестицидную нагрузку и получить качественную и экологически чистую продукцию. В качестве примера рассматривается устойчивость гибридов ро-да Prunus L. к коккомикозу. В настоящее время очень востребованы методы выделения форм с горизонтальной устойчивостью. Сложность выделения таких форм заключается в значительной изменчивости балла поражения растений даже на одном квартале. Зависимость балла поражения от ряда факторов (условий года, расположения дерева в квартале, наличия различных по вирулентности биотипов патогена в популяции, подготовки специалиста и т.д.) часто не позволяет правильно оценивать устойчивость многих сортов. Это подтверждают многочисленные публикации, в которых представлены данные о различной степени поражаемости плодовых растений (сортов, гибридов, подвоев), даже произрастающих в одних и тех же географических районах. Использование биохимических показате-лей, связанных с устойчивостью, позволяет создавать экспресс-методы выделения не поражаемых грибом форм. Разработка таких методов связана с изучением изменчивости биохимических показателей, балла поражения и связей между ними с помощью генетико-статистического анализа. Для выделения форм-эталонов, то есть растений с четкой реакцией на патоген (не поражаемых грибом, с элементами горизонтальной устойчиво-сти, с поздним развитием инфекции) необходимо проводить искусственное заражение различными биотипами. В статье предложен методологический подход к оценке устойчивости генотипов косточковых культур на основе использования в комплексе – биохимических, генетико-статистических, иммунологических методов.

Ссылка на статью
Кузнецова А. П., Степанов И. В. ГЕНЕТИКО-СТАТИСТИЧЕСКИЕ И БИОХИМИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ВЫДЕЛЕНИЯ СОРТОВ ЧЕРЕШНИ И ВИШНИ УСТОЙЧИВЫХ К ФИТОПАТОГЕНАМ [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2017. № 48(6). С. 73–84. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/17/06/09.pdf. (дата обращения: 02.10.2023).
pdf
651 Кб
11 с.
Размножение и производство посадочного материала
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 634.232:58.085: 631.527
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-91-101
Ключевые слова: ЧЕРЕШНЯ, ЭМБРИОКУЛЬТУРА, IN VITRO, СОРТА, ГИБРИДЫ, СТРАТИФИКАЦИЯ

Реферат

Представлены результаты оценки влияния различных по продолжительности коротких сроков стратификации на получение здоровых микрорастений гибридов черешни из изолированных незрелых эмбрионов в культуре in vitro. Изучались три сорта черешни сверхраннего, раннего и среднего сроков созревания. Апробирована схема стерилизации незрелых костянок черешни с использованием дезинфицирующего средства в виде таблеток, содержащих натриевую соль дихлоризоциануровой кислоты. Применённый метод показал высокую эффективность, что проявлялось в низком проценте инфицированных пробирок. Было произведено 3 посева в различные сроки: сразу после съёма плодов, через 1 неделю, через 3 недели стратификации. Степень развития растений, введённых в культуру in vitro, определяли через 2, 3 и 5 недель. Оценку растений, имеющих корень и настоящие листья, проводили по 5-ти балльной шкале. На основании данных учёта степени развития растений, введённых в культуру in vitro, был построен график, показывающий, что наибольший процент нормально развивающихся эмбрионов сорта черешни Краснодарская ранняя наблюдался в группе, прошедшей стратификацию в течение трёх недель, по сравнению со стратифицированными одну неделю. В группе образцов сорта Краса Кубани наблюдается противоположная зависимость. Темпы и степень развития зародышей сорта Ярославна без стратификации находятся в среднем диапазоне между другими изучаемыми образцами с длительной и короткой стратификацией. Исходя из полученных данных, можно сделать вывод о превалировании сортовых особенностей образцов над длительностью стратификации в процессе увеличения выхода нормально развитых микрорастений, полученных из культуры эмбрионов черешни in vitro.

Ссылка на статью
Токмаков С. В., Супрун И. И., Степанов И. В., Лободина Е. В., Алехина Е. М. ВЛИЯНИЕ КОРОТКИХ ПЕРИОДОВ СТРАТИФИКАЦИИ НА РАЗВИТИЕ ИЗОЛИРОВАННЫХ НЕЗРЕЛЫХ ЭМБРИОНОВ ЧЕРЕШНИ В КУЛЬТУРЕ IN VITRO [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 91–101. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/10.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-91-101 (дата обращения: 02.10.2023).
pdf
580 Кб
10 с.
Генетические ресурсы, сортоизучение, селекция
Дата публикации: 18.11.2019
УДК: 575.22
DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-21-30
Ключевые слова: САКУРА, P. SERRULATA, ISSR, ДНК-ТЕХНОЛОГИИ, ГЕНОТИПИРОВАНИЕ, ПЦР

Реферат

К числу наиболее важных мультилокусных маркерных систем относятся ISSR маркеры, основанные на полиморфизме областей генома, расположенных между микросателлитными участками. Их эффективность в генетических работах была продемонстрирована в обширном списке исследований, в которых они были задействованы. Маркеры ISSR просты в использовании, не требуют значительных материальных затрат и методологически менее требовательны по сравнению со многими другими маркерными системами, что делает их надежными генетическими маркерами для начальных этапов исследования организмов, по которым генетическая информация отсутствует. Целью данной работы является поиск и обнаружение эффективных ISSR-маркеров для генотипирпования представителей вида P. serrulata. Показаны результаты апробации ISSR маркеров на генотипах вида P. serrulata. Исходя из качества полученного ДНК-фингерпринта, по каждому из задействованных в работе маркеров был осуществлён отбор наиболее информативных ISSR. Праймеры отобранных ISSR маркеров будут использованы для генотипирования. В результате выполненной работы на генотипах сакуры из 35 ISSR маркеров 26 дали ДНК-фрагменты при постановке ПЦР. При этом 8 маркеров из общей выборки были определены как перспективные для дальнейшей работы. В группу перспективных маркеров вошли ISSR, обладающие наибольшим количеством амплифицированных фрагментов и легко интерпритируемым видом ДНК-фингерпринтов. К данной группе отнесены: UBC 811, UBC 813, UBC 818, UBC 825, UBC 843, UBC 864, 3A59, ASSR02. Дальнейшая работа будет направлена на проведение оценки генетического полиморфизма отобранных маркеров с последующим расширением объёма анализируемой выборки образцов.

Ссылка на статью
Степанов И. В., Дрыгина А. И. ПОИСК ЭФФЕКТИВНЫХ ISSR МАРКЕРОВ ДЛЯ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ВИДА P. SERRULATA * [Электронный ресурс] // Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019. № 60(6). С. 21–30. URL: http://journalkubansad.ru/pdf/19/06/03.pdf. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-6-60-21-30 (дата обращения: 02.10.2023).